民眾黨立委黃國昌今（11）日質詢時指出，助理費修法的爭議，他一再強調公費公用是沒有辦法退讓的底線，但當年「國務機要費除罪化」修法被質疑為個案修法，當時的法務部噤若寒蟬，與如今的態度迥異，批評民進黨同為「除罪化」態度雙標。另審計部今日也印證，黃國昌當時揭露大同醫護違法履約的採購弊案。
針對「助理費除罪化」修法，法務部書面報告指出，本案涉及公共利益及廉政要求，建請廣納各方意見，審慎研議，依司法院釋字第499號解釋理由：「利益迴避乃任何公職人員行使職權均應遵守之原則」；且依憲法增修條文規定，單獨增加立委報酬或待遇之規定，應自次屆起實施。
黃國昌今日在立法院司法及法制委員會質詢，他回顧，透過法律修法為個案解套或免除刑事責任，在我國憲政史上最有名的是2013年5月31日《會計法》修正，那次修正在院會沒有經過任何討論，四個黨團黨鞭在議場後方小會議簽了協商結論，通過後引發軒然大波，導致時任總統馬英九、民進黨主席蘇貞昌出面道歉，行政院長江宜樺也提出覆議，在不邀請閣揆報告下直接通過覆議推翻原決議。
他接著指出，關於國會助理費法制化，開始出現制度化是否在幫個案解套質疑，當然有討論必要，「公費公用」是沒有辦法退的底線。同時如果跟自己職權相關，在下一屆才適用是憲政上是合宜做為。但他質疑，2020他離開立院，最關心的是國務機要費除罪化，當時眼睜睜看著立院2022年為個案修法，如今法務部報告寫得擲地有聲，當年法務部卻是噤若寒蟬。
黃國昌舉出2022年法務部在國務機要費除罪化的書面報告寫著「對於國務機要費將來是否修法除罪化，本部尊重主管機關及大院職權」，與法務部在今天書面文字所表達態度在「除罪化」意見的不一致。法務部法制司長洪家原則說明，基於各部會分工，尊重主管機關、立法院的職權行使，這立場今天沒有改變，但針對此事應認真探究在法評價上的意義、意涵。
黃國昌再回顧，國務機要費當年除罪化的立法討論一片空白，委員會報告詢答時，民進黨提案停止詢答、沒有詢答，在大體討論時沒有討論，另在逐條討論時，民進黨同樣提案停止討論，全案保留送院會，會議僅14分鐘散會，而在黨團協商因人數未到齊，最終送院會處理，而在院會沒有廣泛討論、逐條討論。
黃國昌怒批，《會計法》第99條之1國務機要費除罪化立法討論一片空白，從委員會到黨團協商，再到院會沒有討論，民進黨不是說「沒有討論沒有民主？」還是只要特定案件，只要符合民進黨的利益不用討論，為什麼要討論？當初國務機要費除罪化修法，民進黨挾人數優勢，強行沒收了立法院所有的討論，對比本屆國會民進黨時常高喊的沒有討論沒有民主，真的是無比諷刺。
另外，黃國昌持續追蹤大同醫護違法履約的採購弊案，他指出，數發部全額補助大同醫護，取得資案院標案，卻違法履約、驗收不實，然而，數發部與資安院官官相護，彼此包庇，上下交相賊，甚至還在討論要怎麼處理。
審計部副審計長李順保表示，實際查核發現，資安院沒有落實履約管理，另外廠商繳交不實文件，也超越原來契約規定時間，也沒有依照規定檢討刊登政府採購公報。並指出，委員質詢時，就已經列管此案，10月1日有函請資安院檢討改善，並且要查阻相關人員的違失責任，數發部12月有申覆，啟動採購法廠商停權，跟資安院人員責任檢討，涉及廠商刑責部分移請調查單位偵辦中。
