和碩董事長童子賢19日上午證實，8月15日舉辦的核三重啟公投辯論，他將擔任正方辯論代表。知情綠營人士向「鏡週刊」表示，童子賢素來與總統賴清德關係親近，如今竟擔任核三延役的正方辯護人，讓綠營內部大感震撼。
核三廠重啟公投於8月23日舉行，中央選舉委員會規劃在8月7日至15日期間，舉行5場公辦電視發表會或辯論會，讓正反雙方表達意見。18日傳出，和碩聯合科技董事長童子賢名列支持重啟核三的正方代表，因他身兼總統府氣候變遷對策委員會副召集人，引發外界關注賴政府的反核立場是否鬆動。
重啟核三公投案由民眾黨提出，正方代表共5人，民眾黨推薦3人，包括童子賢、立委黃國昌和清華大學工程與系統科學系特聘教授葉宗洸；國民黨則推薦立委翁曉玲與核能流言終結者創辦人黃士修。
黃國昌表示，童子賢是他邀請的；民眾黨團主任陳智菡表示，辯論代表名單已提交立法院，預料已轉交中選會，正方代表皆具專業背景與公共政策參與經驗；其中，童子賢一向對於新式核能持開放立場，此次受邀代表正方參與辯論，被視為產業界對核能議題的具體回應。
核三重啟公投案的反方代表由行政院遴選，由行政院能源與減碳辦公室副執行長林子倫和台電董事長曾文生擔任。行政院發言人李慧芝表示，二人結合學術與實務背景，能代表政府立場與社會溝通，將積極參與辯論，說明反對核三重啟的立場與理由。
不過，對於童子賢擔任核三重啟的正方辯護人，民進黨內部相當錯愕。知情綠營人士指出，童子賢身為總統府氣候變遷委員會副召集人，擁核立場一向明確，與民進黨過去一貫的反核立場牴觸，因此引發不少爭議；雖然核三公投跨越同意門檻需488萬票的機率不高，但童子賢素來與總統賴清德關係親近，如今，童子賢竟然為正方辯護，還是令人相當錯愕。
對於賴政府的反核立場，李慧芝回應，面對核電廠議題，總統賴清德及行政院長卓榮泰一直強調的，是必須滿足「核安無虞」、「核廢有解」「社會有共識」三原則。
