行政院針對立法院修法案提出覆議，是否由行政院長卓榮泰到立法院說明，引發廣泛討論。卓榮泰11日表態強調，完全尊重立法院的任何決定，並希望有機會向立委更清楚表達行政院的立場，這也是憲政秩序的互動之一。對此，國民黨立委洪孟楷砲轟，這證明卓榮泰無時無刻都在想著選舉，無心執政。
立法院5月28日三讀通過《立法院職權行使法》與《刑法》部分條文修正案，相關函文已送抵行政院。行政院提出7點理由，認為上述條文窒礙難行，並於6月6日的院會中通過覆議案，呈請總統核可後，將移請立法院覆議。卓榮泰強調，總統賴清德會審慎檢視咨文中的覆議理由與內容，目前行政院尚未接到總統府的相關來文。
卓榮泰表示，一旦進入程序，行政院會依照程序，正正當當面對覆議案。他也強調，不便多談其他活動，但需顧及整件事情的發展過程及民意反映。他希望能有機會向立委清楚表達行政院的立場，促使行政、立法兩院進行憲政秩序的互動。
針對行政院提出的覆議案，卓榮泰表示，覆議程序完全依照憲政秩序，行政院會正當、自然而然面對。他強調，完全尊重立法院的決定，並希望有時間能向立委表達立場，以促進行政與立法的互動，這也是國人樂見的局面。
對此，國民黨立委洪孟楷表示，立法院將在最快時間內召開朝野協商，並請立法院長韓國瑜召集協商覆議案的處理時間，確認是否邀請卓榮泰前來說明，但民進黨恐怕會利用暴力杯葛議事，故意拖過法定決議時間，呼籲民進黨不要無時無刻都想著選舉，沒有執政、沒有治國，只會對台灣造成傷害。
行政院經提出覆議後，民進黨也準備啟動各地宣講，宣導反對國會改革法案。洪孟楷批評，這樣的行動顯示執政黨無時無刻都在想著選舉，沒有真正關心治國。他指出，過去兩年的全國性選舉已經讓台灣經歷了足夠的政治動盪，現在應該靜下心來，專注於食安、能源和打詐等民生問題。
洪孟楷強調，民進黨若只想著選舉而非治國，只會讓與國人的距離越來越遠。他呼籲執政黨心存百姓，才能讓台灣走向正確的道路。他還提到，2021年的四大公投雖然通過，但2022年的縣市長選舉民進黨仍大敗，2024年也只取得少數執政，這些都是歷史的教訓。
