馬英九基金會人事風波持續擴大，周刊今天（24日）引述消息指出，前總統馬英九掌握有人以「馬辦」名義在大陸「從事不妥之事」，最終交由金溥聰出面整頓，雙方一度在辦公室僵持超過1小時。蕭旭岑稍早也在臉書回應，直指有人持續以影射方式匿名放話，試圖抹黑其人格與兩岸交流，並強調對於任何「破壞兩岸和平與青年交流的惡勢力」，一定會對抗到底。
蕭旭岑表示，近期有人不斷透過影射與匿名放話，企圖抹煞其人格與最單純的兩岸交流，他將正面迎戰。他指出，自己離開後未積極回應此事有兩個原因：一是當前兩岸和平、能源政策及國防等重大議題，更需要國民黨推動，他不希望基金會內部風波影響黨務發展。
二來，他對馬英九心存感念與感謝，即使遭受誤解，也願意維護馬及其家人，但這不代表他可以任由他人藉此抹黑、打擊兩岸關係。蕭旭岑表示，祝福基金會未來持續發展，推動兩岸交流；但若針對其個人操守的抹黑與不實指控持續出現，他將堅決捍衛自身清白。他重申，任何企圖破壞兩岸和平與青年交流的惡勢力，他都將堅決對抗。
蕭旭岑上午受訪時更稱，「我在政壇以來一向清清白白，我從總統府以來從未經手過錢，所以被指控有什麼財政紀律的問題，我同樣十分好奇」。
蕭旭岑說，據他了解，目前馬英九基金會的執行長根本沒經過董事會任命，呼籲董事會深入了解情況，並還他公道，他強調，涉及到清白、名聲之事一定捍衛到底。他也希望，真心愛護國民黨、真心保護馬總統的人不要親痛仇快。
傳金溥聰獲馬授意 逼走蕭旭岑、王光慈
據《鏡週刊》報導，此次風暴起因於基金會一名隨扈離職事件，該名長期跟隨馬英九的隨扈捲入職場管理爭議辭職後，將基金會財務報告等內部資料交給前國安會秘書長金溥聰掌握情況後，先向基金會董事高華柱說明，再由高向馬英九報告，知情人士指出，「整起人事調整案，其實就是馬英九親自發動」。
該人士透露，馬英九手中握有明確證據，近年有人以「馬辦」名義在大陸「從事一些事情」，讓馬認為不妥，因此授權金溥聰與高華柱介入處理人事，強調相關人員可能面臨法律責任。
據報導，基金會的人事調整過程中還一度爆發激烈衝突，上月25日上午10時許，基金會正準備新春拜拜時，金溥聰與前隨扈一行人突然現身馬辦，並試圖進入王光慈辦公室，引發基金會人員阻攔。據現場轉述，王光慈一度與前隨扈發生拉扯，情緒激動喊出「你把我的手弄紅了」。
當時蕭旭岑趕往現場了解情況，雙方轉入會議室持續對峙，金溥聰當場指控蕭、王處理基金會事務存在瑕疵，包括執行長任命程序疑義及調薪自肥，並出示馬英九親筆簽署的委任書，要求兩人立即解職。
蕭旭岑則反指，人士調任命程序具合法性，並逐一解釋相關爭議，但金溥聰態度強硬，表示自己「奉命行事」。王光慈則拿出基金會章程，指出金無權直接處理此事，雙方爭論激烈、互不相讓。
高華柱不願追殺 憤辭代理執行長
僵局之下，高華柱出面調停，表示既然他與金溥聰是受命處理，希望蕭、王配合辭職，「若即刻離開，事情就到此為止，不會再擴大」，並當場保證不會有後續行動。
期間馬英九曾短暫步入會議室，不過未發言亦未表態，蕭旭岑見狀後認為爭論已無意義，表示「若執意如此，那我就離開」，但強調離開不代表涉及不法，而是基於高華柱在場，相信其能妥善處理。他也向金溥聰表示，希望一切以維護馬英九為重，結束這場長達近1小時的衝突。之後高華柱收到辭職信，並對蕭表示「你受委屈了」。
據了解，當日上午11時許，蕭、王離開後，馬英九隨即逐一致電基金會董事，表達「希望支持他的決定」，高華柱則對董事表示，基金會將進行人事調整，並由他暫代執行長。不過事件發展並未就此平息。約一週後，高華柱因與金溥聰在人事處理與責任追究上出現歧見，加上認為不應違背對蕭、王所作承諾，最終請辭代理執行長與董事職務，改由戴遐齡接任。
一名藍營前高層對此感嘆，蕭旭岑與王光慈多年來對馬英九忠心協助，甚至陪同走過司法案件，如今卻被突然切割，「只能說伴君如伴虎」。金溥聰則回應，自己已退休，此次是奉命處理，「若有人亂寫，一定提告」。
基金會內部亦有董事替蕭、王抱屈，認為雙方可能存在誤會，呼籲外界應理性看待，不宜讓事件持續擴大。內部人士也強調，基金會推動兩岸青年交流並不涉及任何利益，相關指控多為外界過度解讀。
此次人事變動亦衝擊既定行程。基金會原規劃今年舉辦10團「大九學堂」赴中交流活動，目前已全數取消，包括原訂下月出發的杭州團亦已辦理退費。
